Il y a 1000 ans le combat entre groudon et kyogre faisai rage après 3h de combat rayquaza le dieux du ciel apparait et intérompe le combat et renvoi les deux pokémon dans leur tanière.
1000 ans plus tard rayquaza redésent sur terre mais pas pour intérompre un combat juste pour aller au marcher pokémon.Il revoit l'humain qui est transformer en pokémon se pokémon lui parla:
-Pour quoi tu es venu ?
-je suis venu pour te parle de lugia le maitre des océans.